Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBDO15205 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBDO15205 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBDO15205 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBDO15205 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms