Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNMO15061 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNMO15061 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNMO15061 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNMO15061 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNMO15061 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNMO15061 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNMO15061 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNMO15061 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNMO15061 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNMO15061 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNMO15061 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNMO15061 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNMO15061 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNMO15061 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNMO15061 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNMO15061 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNMO15061 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNMO15061 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNMO15061 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNMO15061 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNMO15061 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNMO15061 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNMO15061 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNMO15061 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNMO15061 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms