Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRTO14522 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms