Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHLHE40O14503 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHLHE40O14503 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms