Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms