Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms