Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NCBP2LA6PVI3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCBP2LA6PVI3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms