Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD3A6NKT7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD3A6NKT7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms