Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTL1A6NKG5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms