Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C5orf51A6NDU8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms