Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POTEFA5A3E0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POTEFA5A3E0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms