Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
A4D1N5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
A4D1N5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
A4D1N5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms