Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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