Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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