Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC4A4Q9Y6R1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms