Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms