Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHTOPQ9Y3Y2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms