Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVW-1Q9UQF0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms