Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PHF24Q9UPV7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF24Q9UPV7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF24Q9UPV7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF24Q9UPV7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF24Q9UPV7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF24Q9UPV7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHF24Q9UPV7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF24Q9UPV7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHF24Q9UPV7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms