Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCDHA12Q9UN75 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms