Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSPAN16Q9UKR8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms