Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MRTO4Q9UKD2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms