Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MBD1Q9UIS9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MBD1Q9UIS9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms