Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPN3Q9UHW5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms