Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SWAP70Q9UH65 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms