Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms