Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP36Q9P275 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms