Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDL2Q9NX52 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms