Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM28Q9NW13 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM28Q9NW13 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms