Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPRMQ9NS64 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPRMQ9NS64 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms