Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNNM1Q9NRU3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNNM1Q9NRU3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms