Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPCPD1Q9NPB8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPCPD1Q9NPB8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms