Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SSU72Q9NP77 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms