Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ELL3Q9HB65 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms