Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms