Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSER1Q9C0I3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSER1Q9C0I3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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