Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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