Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFIH1Q9BYX4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms