Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms