Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SSBP4Q9BWG4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms