Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HIGD2AQ9BW72 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
HIGD2AQ9BW72 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms