Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PBDC1Q9BVG4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms