Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYT17Q9BSW7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT17Q9BSW7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms