Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM175Q9BSA9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms