Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms