Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BPIFA3Q9BQP9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms