Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TREX2Q9BQ50 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TREX2Q9BQ50 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms