Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITX2Q99697 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms