Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRBNQ96SW2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRBNQ96SW2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms