Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms